Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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TNXAQ16473 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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TNXAQ16473 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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TNXAQ16473 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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TNXAQ16473 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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TNXAQ16473 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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