Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD5Q16401 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD5Q16401 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD5Q16401 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD5Q16401 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD5Q16401 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD5Q16401 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD5Q16401 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD5Q16401 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD5Q16401 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD5Q16401 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD5Q16401 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD5Q16401 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD5Q16401 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD5Q16401 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD5Q16401 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD5Q16401 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD5Q16401 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD5Q16401 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD5Q16401 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD5Q16401 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD5Q16401 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD5Q16401 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD5Q16401 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms