Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZFHX3Q15911 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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