Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITSN1Q15811 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITSN1Q15811 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
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