Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNHIT3Q15649 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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