Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYTH1Q15438 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms