Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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