Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAM2Q15035 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAM2Q15035 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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