Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD6Q15008 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
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