Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NFIXQ14938 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
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