Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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