Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF235Q14590 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF235Q14590 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF235Q14590 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF235Q14590 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF235Q14590 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF235Q14590 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF235Q14590 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF235Q14590 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF235Q14590 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF235Q14590 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF235Q14590 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF235Q14590 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF235Q14590 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF235Q14590 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF235Q14590 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF235Q14590 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF235Q14590 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF235Q14590 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms