Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN5AQ14524 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
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