Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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RBM39Q14498 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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RBM39Q14498 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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RBM39Q14498 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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RBM39Q14498 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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RBM39Q14498 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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RBM39Q14498 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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RBM39Q14498 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBM39Q14498 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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RBM39Q14498 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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RBM39Q14498 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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RBM39Q14498 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBM39Q14498 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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