Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
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