Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms