Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H3Q13889 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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