Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA9Q13797 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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