Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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