Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BFSP2Q13515 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BFSP2Q13515 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
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