Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LSAMPQ13449 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
LSAMPQ13449 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms