Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLN3Q13286 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
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