Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3FQ13275 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
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