Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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