Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
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