Protein–RNA interactions for Protein: Q12377

RPN6, 26S proteasome regulatory subunit RPN6, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN6Q12377 RIM11YMR139W 1113 nt3.46□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 DAN4YJR151C 3486 nt3.46□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 AIM21YIR003W 2040 nt3.46□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 ALA1YOR335C 2877 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 SPT10YJL127C 1923 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 NOP6YDL213C 678 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 ENT5YDR153C 1236 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 COX18YGR062C 951 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 SPT4YGR063C 309 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 GTF1YGR102C 552 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 CIR1YGR207C 786 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 ANB1YJR047C 474 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 YUH1YJR099W 711 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 BAT2YJR148W 1131 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 COX19YLL018C-A 297 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 YBL094CYBL094C 333 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 RPS9BYBR189W 588 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 YLR352WYLR352W 2424 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 NSP1YJL041W 2472 nt3.45□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 RNT1YMR239C 1416 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 URA2YJL130C 6645 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 SYT1YPR095C 3681 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 CTK1YKL139W 1587 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 CNN1YFR046C 1086 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 TOS8YGL096W 831 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 MRPL6YHR147C 645 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 MOH1YBL049W 417 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 DSC2YOL073C 969 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 POC4YPL144W 447 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 AIM14YGL160W 1713 nt3.44□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 MTR4YJL050W 3222 nt3.43□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 PUB1YNL016W 1362 nt3.43□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 YAL065CYAL065C 387 nt3.43□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 SPO20YMR017W 1194 nt3.43□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 RAD14YMR201C 1116 nt3.43□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 LDS2YOL047C 1071 nt3.43□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 NDJ1YOL104C 1059 nt3.43□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 RPL18AYOL120C 561 nt3.43□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 RRP36YOR287C 903 nt3.43□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 YBR137WYBR137W 540 nt3.43□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 TRE2YOR256C 2430 nt3.43□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 VPS27YNR006W 1869 nt3.43□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 MEF1YLR069C 2286 nt3.42□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 YDR391CYDR391C 699 nt3.42□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 SOD1YJR104C 465 nt3.42□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 MCK1YNL307C 1128 nt3.42□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 YNR071CYNR071C 1029 nt3.42□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 IAH1YOR126C 717 nt3.42□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 UAF30YOR295W 687 nt3.42□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 YOR338WYOR338W 1092 nt3.42□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 YPL168WYPL168W 1293 nt3.42□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 OPY1YBR129C 987 nt3.42□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 PMT6YGR199W 2280 nt3.42□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 PRS5YOL061W 1491 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 MDN1YLR106C 14733 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 SSL1YLR005W 1386 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 MGR3YMR115W 1506 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 PEX1YKL197C 3132 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 YDL026WYDL026W 312 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 SHU2YDR078C 672 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 YDR290WYDR290W 330 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 RSM25YIL093C 795 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 OMA1YKR087C 1038 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 YAL069WYAL069W 315 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 PNT1YOR266W 1272 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 YPL088WYPL088W 1029 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 TAF14YPL129W 735 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 SSM4YIL030C 3960 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 YJR030CYJR030C 2238 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 CIT1YNR001C 1440 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 TRS120YDR407C 3870 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 MNR2YKL064W 2910 nt3.41□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 ISW2YOR304W 3363 nt3.4□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 ZDS2YML109W 2829 nt3.4□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 YOL019WYOL019W 1656 nt3.4□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 AIP1YMR092C 1848 nt3.4□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 CWC2YDL209C 1020 nt3.4□□□□□ -1.87
RPN6Q12377 IES6YEL044W 501 nt3.4□□□□□ -1.87
RPN6Q12377 RPS8BYER102W 603 nt3.4□□□□□ -1.87
RPN6Q12377 POP6YGR030C 477 nt3.4□□□□□ -1.87
RPN6Q12377 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.4□□□□□ -1.87
RPN6Q12377 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.4□□□□□ -1.87
RPN6Q12377 TMA19YKL056C 504 nt3.4□□□□□ -1.87
RPN6Q12377 NIT3YLR351C 876 nt3.4□□□□□ -1.87
RPN6Q12377 RPS8AYBL072C 603 nt3.4□□□□□ -1.87
RPN6Q12377 PSF3YOL146W 585 nt3.4□□□□□ -1.87
RPN6Q12377 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.4□□□□□ -1.87
RPN6Q12377 RPL19AYBR084C-A 570 nt3.4□□□□□ -1.87
RPN6Q12377 YFL040WYFL040W 1623 nt3.4□□□□□ -1.87
RPN6Q12377 KAP95YLR347C 2586 nt3.4□□□□□ -1.87
RPN6Q12377 YLR177WYLR177W 1887 nt3.39□□□□□ -1.87
RPN6Q12377 RCR2YDR003W 633 nt3.39□□□□□ -1.87
RPN6Q12377 ADH4YGL256W 1149 nt3.39□□□□□ -1.87
RPN6Q12377 YJR096WYJR096W 849 nt3.39□□□□□ -1.87
RPN6Q12377 MRPL20YKR085C 588 nt3.39□□□□□ -1.87
RPN6Q12377 FOL3YMR113W 1284 nt3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.4 ms