Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 UBP15YMR304W 3693 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 SNQ2YDR011W 4506 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 SEC26YDR238C 2922 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 RGR1YLR071C 3249 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 RPL13BYMR142C 600 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 TYR1YBR166C 1359 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 YRM1YOR172W 2361 nt4.13□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 YMR082CYMR082C 357 nt4.13□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 PAU14YIL176C 363 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 PAU1YJL223C 363 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 ANB1YJR047C 474 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 SSQ1YLR369W 1974 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 MHO1YJR008W 1017 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 RPL17AYKL180W 555 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 SFH1YLR321C 1281 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 TFB4YPR056W 1017 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 IZH3YLR023C 1632 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 RAM1YDL090C 1296 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 RPS22AYJL190C 393 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 PRE2YPR103W 864 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 YCL022CYCL022C 516 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 URK1YNR012W 1506 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 PET54YGR222W 882 nt4.1□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 YHR213WYHR213W 597 nt4.1□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 YAR062WYAR062W 597 nt4.1□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 YSH1YLR277C 2340 nt4.1□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 YIL163CYIL163C 354 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 PHD1YKL043W 1101 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 SDH3YKL141W 597 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 RBL2YOR265W 321 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 FZO1YBR179C 2568 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 DHH1YDL160C 1521 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 TDA11YHR159W 1515 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-GR3Q12316 VTC1YER072W 390 nt4.09□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 MNT4YNR059W 1743 nt4.08□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 APL6YGR261C 2430 nt4.08□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 RHO5YNL180C 996 nt4.08□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 DGA1YOR245C 1257 nt4.08□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 OSH2YDL019C 3852 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 HOS3YPL116W 2094 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 RTT103YDR289C 1230 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 YOR050CYOR050C 348 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 ECM2YBR065C 1095 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 GAT2YMR136W 1683 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 FMP25YLR077W 1752 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 PTI1YGR156W 1278 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 RSA1YPL193W 1146 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 BEM4YPL161C 1902 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 BCK1YJL095W 4437 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 SPO71YDR104C 3738 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 HPC2YBR215W 1878 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 NPR3YHL023C 3441 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 GRX6YDL010W 696 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 GCD6YDR211W 2139 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 MIC27YNL100W 705 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 SEO1YAL067C 1782 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 KRI1YNL308C 1776 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 PUT3YKL015W 2940 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 TSR1YDL060W 2367 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 RPL33AYPL143W 324 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 YBR242WYBR242W 717 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 RIB5YBR256C 717 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 AUS1YOR011W 4185 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 YDR061WYDR061W 1620 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 FCF1YDR339C 570 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 RRP46YGR095C 672 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 PSY1YKL076C 384 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 BET3YKR068C 582 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 IRC20YLR247C 4671 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1B-GR3Q12316 TRK1YJL129C 3708 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 YML119WYML119W 1074 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 FUN12YAL035W 3009 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 YLR152CYLR152C 1731 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 YDL241WYDL241W 372 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 SFH5YJL145W 885 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 RRD2YPL152W 1077 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 YDL124WYDL124W 939 nt4□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 MAF1YDR005C 1188 nt4□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 GRE3YHR104W 984 nt4□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 YKR033CYKR033C 426 nt4□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 END3YNL084C 1050 nt4□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 PTR2YKR093W 1806 nt4□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 GSM1YJL103C 1857 nt4□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 PMR1YGL167C 2853 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 LDS2YOL047C 1071 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 GIP3YPL137C 3831 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 MRPL37YBR268W 318 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 APL5YPL195W 2799 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 FMP33YJL161W 543 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 RPB8YOR224C 441 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 AYR1YIL124W 894 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 MSB1YOR188W 3414 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 CDC6YJL194W 1542 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 YLR352WYLR352W 2424 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 FRE1YLR214W 2061 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 SWP1YMR149W 861 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 MCA1YOR197W 1299 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1B-GR3Q12316 DIM1YPL266W 957 nt3.97□□□□□ -1.77
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