Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 DAP2YHR028C 2457 nt4.15□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 PRM15YMR278W 1869 nt4.15□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 GYP7YDL234C 2241 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 PEP1YBL017C 4740 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 TRE2YOR256C 2430 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 UBP15YMR304W 3693 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 SNQ2YDR011W 4506 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 SEC26YDR238C 2922 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 RGR1YLR071C 3249 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 RPL13BYMR142C 600 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 TYR1YBR166C 1359 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 YRM1YOR172W 2361 nt4.13□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 YMR082CYMR082C 357 nt4.13□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 PAU14YIL176C 363 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 PAU1YJL223C 363 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 ANB1YJR047C 474 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 SSQ1YLR369W 1974 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 MHO1YJR008W 1017 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 RPL17AYKL180W 555 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 SFH1YLR321C 1281 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 OSH2YDL019C 3852 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 IZH3YLR023C 1632 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 RAM1YDL090C 1296 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 RPS22AYJL190C 393 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 PRE2YPR103W 864 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 YCL022CYCL022C 516 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 URK1YNR012W 1506 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 PET54YGR222W 882 nt4.1□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 YHR213WYHR213W 597 nt4.1□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 YAR062WYAR062W 597 nt4.1□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 YSH1YLR277C 2340 nt4.1□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 YIL163CYIL163C 354 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 PHD1YKL043W 1101 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 SDH3YKL141W 597 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 RBL2YOR265W 321 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 DHH1YDL160C 1521 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 TDA11YHR159W 1515 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-BRQ12193 YDL023CYDL023C 321 nt4.09□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 VTC1YER072W 390 nt4.09□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 MNT4YNR059W 1743 nt4.08□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 RHO5YNL180C 996 nt4.08□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 DGA1YOR245C 1257 nt4.08□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 HOS3YPL116W 2094 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 RTT103YDR289C 1230 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 YOR050CYOR050C 348 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 ECM2YBR065C 1095 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 GAT2YMR136W 1683 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 MBP1YDL056W 2502 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 FMP25YLR077W 1752 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 PTI1YGR156W 1278 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 RSA1YPL193W 1146 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 YBR226CYBR226C 411 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 BEM4YPL161C 1902 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 BCK1YJL095W 4437 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 SPO71YDR104C 3738 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 NPR3YHL023C 3441 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 GRX6YDL010W 696 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 YDL124WYDL124W 939 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 GCD6YDR211W 2139 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 MIC27YNL100W 705 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 SEO1YAL067C 1782 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 KRI1YNL308C 1776 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 PUT3YKL015W 2940 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 TSR1YDL060W 2367 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 YML119WYML119W 1074 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 RPL33AYPL143W 324 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 YBR242WYBR242W 717 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 RIB5YBR256C 717 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 AUS1YOR011W 4185 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 CHS5YLR330W 2016 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 FRE1YLR214W 2061 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 YDR061WYDR061W 1620 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 FCF1YDR339C 570 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 DBF2YGR092W 1719 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 RRP46YGR095C 672 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 PSY1YKL076C 384 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 BET3YKR068C 582 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 IRC20YLR247C 4671 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1B-BRQ12193 TRK1YJL129C 3708 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 FUN12YAL035W 3009 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 YLR152CYLR152C 1731 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 YKR023WYKR023W 1593 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 YDL241WYDL241W 372 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 SFH5YJL145W 885 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 RRD2YPL152W 1077 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 GSM1YJL103C 1857 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 MAF1YDR005C 1188 nt4□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 PDE1YGL248W 1110 nt4□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 GRE3YHR104W 984 nt4□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 YKR033CYKR033C 426 nt4□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 END3YNL084C 1050 nt4□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 PTR2YKR093W 1806 nt4□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 PMR1YGL167C 2853 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 LDS2YOL047C 1071 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 GIP3YPL137C 3831 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 MRPL37YBR268W 318 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 SPC97YHR172W 2472 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 APL5YPL195W 2799 nt3.99□□□□□ -1.77
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