Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP1B1Q10567 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1B1Q10567 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms