Protein–RNA interactions for Protein: Q09327

MGAT3, Beta-1,4-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT3Q09327 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MGAT3Q09327 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MGAT3Q09327 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms