Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM27E3Q08E93 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms