Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms