Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms