Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SOS1Q07889 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOS1Q07889 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOS1Q07889 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms