Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KRTAP1-1Q07627 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KRTAP1-1Q07627 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KRTAP1-1Q07627 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRTAP1-1Q07627 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRTAP1-1Q07627 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRTAP1-1Q07627 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRTAP1-1Q07627 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRTAP1-1Q07627 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KRTAP1-1Q07627 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRTAP1-1Q07627 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRTAP1-1Q07627 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRTAP1-1Q07627 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRTAP1-1Q07627 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP1-1Q07627 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms