Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FMODQ06828 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FMODQ06828 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FMODQ06828 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FMODQ06828 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FMODQ06828 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FMODQ06828 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FMODQ06828 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FMODQ06828 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FMODQ06828 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FMODQ06828 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FMODQ06828 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FMODQ06828 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FMODQ06828 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FMODQ06828 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FMODQ06828 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FMODQ06828 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FMODQ06828 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FMODQ06828 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FMODQ06828 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FMODQ06828 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FMODQ06828 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FMODQ06828 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FMODQ06828 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FMODQ06828 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FMODQ06828 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FMODQ06828 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FMODQ06828 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FMODQ06828 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FMODQ06828 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FMODQ06828 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FMODQ06828 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FMODQ06828 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FMODQ06828 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FMODQ06828 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FMODQ06828 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FMODQ06828 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FMODQ06828 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FMODQ06828 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FMODQ06828 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FMODQ06828 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FMODQ06828 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FMODQ06828 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FMODQ06828 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FMODQ06828 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FMODQ06828 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FMODQ06828 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FMODQ06828 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FMODQ06828 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FMODQ06828 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FMODQ06828 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FMODQ06828 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FMODQ06828 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FMODQ06828 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FMODQ06828 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FMODQ06828 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FMODQ06828 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FMODQ06828 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FMODQ06828 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FMODQ06828 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FMODQ06828 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FMODQ06828 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FMODQ06828 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FMODQ06828 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FMODQ06828 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FMODQ06828 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FMODQ06828 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FMODQ06828 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FMODQ06828 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FMODQ06828 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FMODQ06828 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FMODQ06828 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FMODQ06828 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FMODQ06828 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FMODQ06828 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FMODQ06828 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FMODQ06828 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FMODQ06828 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FMODQ06828 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FMODQ06828 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FMODQ06828 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FMODQ06828 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FMODQ06828 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FMODQ06828 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FMODQ06828 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FMODQ06828 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FMODQ06828 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FMODQ06828 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FMODQ06828 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FMODQ06828 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FMODQ06828 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FMODQ06828 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FMODQ06828 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FMODQ06828 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FMODQ06828 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FMODQ06828 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FMODQ06828 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FMODQ06828 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FMODQ06828 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FMODQ06828 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms