Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
EXOSC9Q06265 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms