Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms