Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms