Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ATP7AQ04656 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ATP7AQ04656 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms