Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4A11Q02928 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms