Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms