Protein–RNA interactions for Protein: Q02086

SP2, Transcription factor Sp2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP2Q02086 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP2Q02086 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP2Q02086 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP2Q02086 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP2Q02086 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SP2Q02086 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP2Q02086 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SP2Q02086 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP2Q02086 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP2Q02086 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP2Q02086 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP2Q02086 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SP2Q02086 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP2Q02086 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP2Q02086 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP2Q02086 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP2Q02086 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP2Q02086 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP2Q02086 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP2Q02086 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP2Q02086 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP2Q02086 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SP2Q02086 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP2Q02086 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP2Q02086 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SP2Q02086 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP2Q02086 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP2Q02086 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP2Q02086 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP2Q02086 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP2Q02086 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP2Q02086 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP2Q02086 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP2Q02086 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP2Q02086 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP2Q02086 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP2Q02086 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP2Q02086 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP2Q02086 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP2Q02086 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SP2Q02086 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP2Q02086 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP2Q02086 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP2Q02086 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP2Q02086 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP2Q02086 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SP2Q02086 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP2Q02086 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP2Q02086 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP2Q02086 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP2Q02086 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP2Q02086 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP2Q02086 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP2Q02086 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP2Q02086 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP2Q02086 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP2Q02086 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP2Q02086 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP2Q02086 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP2Q02086 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SP2Q02086 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP2Q02086 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP2Q02086 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SP2Q02086 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP2Q02086 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP2Q02086 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP2Q02086 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP2Q02086 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SP2Q02086 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP2Q02086 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SP2Q02086 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP2Q02086 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP2Q02086 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP2Q02086 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP2Q02086 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP2Q02086 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP2Q02086 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP2Q02086 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP2Q02086 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SP2Q02086 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP2Q02086 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP2Q02086 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP2Q02086 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP2Q02086 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP2Q02086 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP2Q02086 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP2Q02086 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SP2Q02086 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP2Q02086 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP2Q02086 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP2Q02086 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP2Q02086 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SP2Q02086 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP2Q02086 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP2Q02086 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP2Q02086 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP2Q02086 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP2Q02086 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SP2Q02086 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP2Q02086 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms