Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
XPCQ01831 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
XPCQ01831 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
XPCQ01831 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
XPCQ01831 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
XPCQ01831 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
XPCQ01831 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
XPCQ01831 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
XPCQ01831 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
XPCQ01831 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
XPCQ01831 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
XPCQ01831 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
XPCQ01831 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
XPCQ01831 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
XPCQ01831 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
XPCQ01831 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
XPCQ01831 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
XPCQ01831 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
XPCQ01831 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
XPCQ01831 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
XPCQ01831 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
XPCQ01831 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
XPCQ01831 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
XPCQ01831 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
XPCQ01831 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
XPCQ01831 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
XPCQ01831 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
XPCQ01831 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
XPCQ01831 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
XPCQ01831 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
XPCQ01831 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
XPCQ01831 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
XPCQ01831 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
XPCQ01831 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
XPCQ01831 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
XPCQ01831 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
XPCQ01831 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
XPCQ01831 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
XPCQ01831 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
XPCQ01831 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
XPCQ01831 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
XPCQ01831 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
XPCQ01831 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
XPCQ01831 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
XPCQ01831 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
XPCQ01831 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
XPCQ01831 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
XPCQ01831 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
XPCQ01831 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
XPCQ01831 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
XPCQ01831 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
XPCQ01831 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
XPCQ01831 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
XPCQ01831 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
XPCQ01831 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
XPCQ01831 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
XPCQ01831 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
XPCQ01831 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
XPCQ01831 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
XPCQ01831 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
XPCQ01831 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
XPCQ01831 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
XPCQ01831 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
XPCQ01831 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
XPCQ01831 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
XPCQ01831 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
XPCQ01831 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
XPCQ01831 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
XPCQ01831 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
XPCQ01831 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
XPCQ01831 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
XPCQ01831 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
XPCQ01831 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
XPCQ01831 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
XPCQ01831 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
XPCQ01831 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
XPCQ01831 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
XPCQ01831 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
XPCQ01831 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
XPCQ01831 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
XPCQ01831 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
XPCQ01831 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
XPCQ01831 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
XPCQ01831 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
XPCQ01831 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
XPCQ01831 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
XPCQ01831 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
XPCQ01831 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
XPCQ01831 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
XPCQ01831 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
XPCQ01831 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
XPCQ01831 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
XPCQ01831 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
XPCQ01831 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
XPCQ01831 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
XPCQ01831 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
XPCQ01831 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
XPCQ01831 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
XPCQ01831 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
XPCQ01831 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms