Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSG4Q00888 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG4Q00888 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG4Q00888 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG4Q00888 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG4Q00888 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG4Q00888 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG4Q00888 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG4Q00888 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG4Q00888 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms