Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP5P82980 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP5P82980 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP5P82980 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP5P82980 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP5P82980 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP5P82980 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP5P82980 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP5P82980 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP5P82980 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP5P82980 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP5P82980 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP5P82980 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP5P82980 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP5P82980 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP5P82980 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP5P82980 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP5P82980 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP5P82980 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP5P82980 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP5P82980 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP5P82980 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP5P82980 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP5P82980 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP5P82980 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP5P82980 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP5P82980 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP5P82980 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP5P82980 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBP5P82980 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBP5P82980 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBP5P82980 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBP5P82980 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBP5P82980 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBP5P82980 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBP5P82980 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBP5P82980 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP5P82980 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP5P82980 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP5P82980 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP5P82980 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP5P82980 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP5P82980 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP5P82980 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP5P82980 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP5P82980 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP5P82980 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP5P82980 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP5P82980 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP5P82980 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP5P82980 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP5P82980 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP5P82980 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP5P82980 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP5P82980 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP5P82980 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP5P82980 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP5P82980 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP5P82980 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP5P82980 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP5P82980 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP5P82980 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP5P82980 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP5P82980 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP5P82980 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP5P82980 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP5P82980 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP5P82980 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP5P82980 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP5P82980 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP5P82980 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP5P82980 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP5P82980 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP5P82980 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP5P82980 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP5P82980 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP5P82980 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP5P82980 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP5P82980 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP5P82980 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP5P82980 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP5P82980 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP5P82980 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP5P82980 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP5P82980 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP5P82980 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP5P82980 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP5P82980 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP5P82980 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP5P82980 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP5P82980 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP5P82980 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP5P82980 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP5P82980 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP5P82980 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP5P82980 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP5P82980 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP5P82980 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP5P82980 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP5P82980 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms