Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFI35P80217 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFI35P80217 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFI35P80217 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFI35P80217 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFI35P80217 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFI35P80217 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFI35P80217 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFI35P80217 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFI35P80217 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFI35P80217 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFI35P80217 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFI35P80217 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFI35P80217 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFI35P80217 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFI35P80217 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFI35P80217 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFI35P80217 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFI35P80217 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFI35P80217 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFI35P80217 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFI35P80217 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IFI35P80217 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFI35P80217 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFI35P80217 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFI35P80217 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFI35P80217 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFI35P80217 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFI35P80217 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFI35P80217 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFI35P80217 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFI35P80217 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFI35P80217 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFI35P80217 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFI35P80217 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFI35P80217 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFI35P80217 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFI35P80217 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFI35P80217 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFI35P80217 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFI35P80217 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFI35P80217 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFI35P80217 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFI35P80217 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFI35P80217 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFI35P80217 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFI35P80217 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFI35P80217 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IFI35P80217 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IFI35P80217 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFI35P80217 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFI35P80217 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IFI35P80217 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFI35P80217 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFI35P80217 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFI35P80217 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFI35P80217 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFI35P80217 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFI35P80217 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFI35P80217 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFI35P80217 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFI35P80217 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFI35P80217 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFI35P80217 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFI35P80217 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFI35P80217 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFI35P80217 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFI35P80217 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFI35P80217 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFI35P80217 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFI35P80217 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFI35P80217 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFI35P80217 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFI35P80217 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFI35P80217 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFI35P80217 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFI35P80217 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFI35P80217 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFI35P80217 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFI35P80217 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFI35P80217 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFI35P80217 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFI35P80217 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IFI35P80217 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFI35P80217 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFI35P80217 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFI35P80217 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IFI35P80217 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFI35P80217 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFI35P80217 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFI35P80217 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFI35P80217 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFI35P80217 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFI35P80217 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFI35P80217 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFI35P80217 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFI35P80217 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFI35P80217 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFI35P80217 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFI35P80217 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms