Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCL7P80098 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCL7P80098 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCL7P80098 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCL7P80098 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCL7P80098 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCL7P80098 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCL7P80098 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCL7P80098 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCL7P80098 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCL7P80098 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCL7P80098 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCL7P80098 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCL7P80098 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCL7P80098 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCL7P80098 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCL7P80098 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCL7P80098 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCL7P80098 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCL7P80098 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCL7P80098 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCL7P80098 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCL7P80098 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCL7P80098 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCL7P80098 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCL7P80098 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCL7P80098 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCL7P80098 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCL7P80098 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCL7P80098 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCL7P80098 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCL7P80098 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCL7P80098 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCL7P80098 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCL7P80098 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL7P80098 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL7P80098 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL7P80098 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL7P80098 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL7P80098 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL7P80098 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL7P80098 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL7P80098 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL7P80098 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL7P80098 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL7P80098 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL7P80098 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL7P80098 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL7P80098 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL7P80098 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL7P80098 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL7P80098 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL7P80098 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL7P80098 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL7P80098 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL7P80098 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL7P80098 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL7P80098 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL7P80098 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL7P80098 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL7P80098 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL7P80098 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL7P80098 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL7P80098 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL7P80098 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL7P80098 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL7P80098 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL7P80098 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL7P80098 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCL7P80098 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCL7P80098 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCL7P80098 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCL7P80098 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCL7P80098 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCL7P80098 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCL7P80098 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCL7P80098 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCL7P80098 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCL7P80098 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCL7P80098 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL7P80098 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL7P80098 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL7P80098 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL7P80098 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL7P80098 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL7P80098 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL7P80098 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL7P80098 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL7P80098 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL7P80098 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL7P80098 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL7P80098 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL7P80098 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL7P80098 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL7P80098 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL7P80098 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL7P80098 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL7P80098 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL7P80098 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL7P80098 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms