Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX5P78411 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX5P78411 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX5P78411 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX5P78411 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX5P78411 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX5P78411 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX5P78411 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX5P78411 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX5P78411 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX5P78411 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX5P78411 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX5P78411 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX5P78411 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX5P78411 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX5P78411 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX5P78411 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX5P78411 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX5P78411 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX5P78411 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX5P78411 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX5P78411 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX5P78411 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX5P78411 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX5P78411 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX5P78411 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX5P78411 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX5P78411 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX5P78411 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX5P78411 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX5P78411 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX5P78411 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX5P78411 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX5P78411 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX5P78411 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX5P78411 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX5P78411 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX5P78411 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX5P78411 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX5P78411 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX5P78411 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX5P78411 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX5P78411 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX5P78411 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IRX5P78411 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IRX5P78411 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX5P78411 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX5P78411 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX5P78411 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX5P78411 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX5P78411 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX5P78411 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX5P78411 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX5P78411 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX5P78411 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX5P78411 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX5P78411 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX5P78411 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX5P78411 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX5P78411 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX5P78411 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX5P78411 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX5P78411 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX5P78411 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX5P78411 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX5P78411 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX5P78411 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX5P78411 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX5P78411 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX5P78411 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX5P78411 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX5P78411 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX5P78411 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX5P78411 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX5P78411 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX5P78411 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX5P78411 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX5P78411 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX5P78411 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX5P78411 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX5P78411 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX5P78411 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX5P78411 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX5P78411 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX5P78411 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX5P78411 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX5P78411 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX5P78411 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX5P78411 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX5P78411 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX5P78411 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX5P78411 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX5P78411 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX5P78411 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX5P78411 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX5P78411 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX5P78411 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX5P78411 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX5P78411 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX5P78411 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms