Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEP78395 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEP78395 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms